果树研究所，主要任务是以生物技术与常规技术相结合，培育适合我省栽植的果树品种，解决育种中出现的重大关键性技术问题，开展与寒地果树育种研究相关的生理、生化、生态与环境及病虫害、加工等应用技术研究;开展我省苹果、梨主栽品种脱毒苗木工厂化生产技术研究;研究寒地果树病虫害的发生规律，生物防治方法和肥料高效施用方法，指导有机果品基地建设。 果树学科成立于1960年，现有科技人员13人，具有博士学位1人，硕士学位11人，正高级职称4人、副高级职称2人、中级职称5人、初级职称2人。共审定果树品种23个，包括苹果品种6个，分别是龙冠、龙丰、龙红、K9、紫香、龙帅；梨品种7个，分别是金香水、红金秋、东宁五号(牡育68-3)、早香水、秋月、雪香、金恬; 黑穗醋栗品种5个:早丰、黑丰、寒丰、晚丰、丹江黑；李品种4个:牡红甜李、矮甜李、牡丰李、秋甜李；杏品种1个牡红杏。其中“龙丰"苹果，是我省第一个国审果树品种，并获国家地理标志保护。 保存国内外果树抗寒育种资源200余份，配制苹果、梨、李、杏、黑穗醋栗杂交组合 300 多个，保存杂种苗3万株。杂交苗的亲本引入优质、矮化、多倍体、抗病等基因，性状优良，基因资源丰富。 承担国家苹果产业技术体系东北寒地综合试验站、寒地果树产业星创天地、黑龙江省果树技术创新中心、寒地果树育种栽培省级重点实验室、黑龙江省寒地果树研究开发及生产中试基地等平台的工作任务，先后实施国家省市级成果转化、自然基金、科技攻关等课题和研究项目 60 多项。